用STRING数据库将CRC PPI网络构建完成后,我们进行了重启型随机游走分析,识别出了该网络中亲和力分数较高的前50个节点,包

用STRING数据库将CRC.PPI网络构建完成后,我们进行了重启型随机游走分析,识别出了该网络中亲和力分数较高的前50个节点,包括DEP结构域含有雷帕霉素靶蛋白相互作用蛋白(DEP domain containing MTOR-interacting protein,DEPTOR),乳腺癌扩时间增序列-1(breast carcinoma amplified sequence-1,BCAS1),神经前体细胞表达发育下调9(neural precursor cell expressed developmentally down-regulated 9,NEDD也许9)和有丝分裂原激活蛋白激酶2(mitogen-activated protein kinase kinase 2,MAP2K2)等。在CRC.PPI网络中亲和力分数较高的前50个节点包括14个上调基因,17个下调基因和19个无差异表达的基因,它们之间有224条相互作这个用的边,包括DEPTOR-CCND1,AURKA-BCAS1,CCND1-BCAS1,CCND1-NEDD9和CCND1-MAP2K2等。我们从前50个节点中总共筛选出31个差异表达基因,其中只有5个是种子基因,另外26个是非种子基因。以p值小于0.05为筛选标准,我们利用DAVID在线工具对这31个差异表达基因进行了GO功能和KEGG通路富集分析。

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