KEGG信号通路富集分析发现,差异表达的基因主要在Fat digestion and absorption、PPAR signaling pathway、HIF-1 signaling pathway以及TNF signaling pathway等途径中富查看更多集;(4)PPI蛋白互作网络显示FN1、TIMP1及SERPINA1等基因是差异基因网络的核心基因;(5)利用BART对625个差异mRNA进行预测,获得73个转录因子,这些转录因子在耐药细胞中的表达水平均未发生显著改变;(6)成R406功构建了miRNA-mRNA、lncRNA-miRNA-mRNA和circRNA-miRNA-mRNA调控网络,从全转录组层面直观展示索拉菲尼耐药肝癌细胞差异表达基因之间的内在调控关系;(7)利用GO富集分析发现,在索拉菲尼耐药肝Batimastat细胞系癌细胞中表达上调的基因有33个富集于凋亡/死亡生物进程,而表达下调的基因未见凋亡/死亡相关生物进程的富集;(8)富集于生物学进程的33个基因仅有1个处于上调的circRNA调控网络中,而处于上调的lncRNA调控网络则有14个,且均为网络中TCONS＿00284048和TCONS＿00006019的靶基因。